Yayasan Pondok Pesantren Hudaatul Umam memiliki berbagai tingkatan Program Pendidikan yang bertujuan untuk mencerdaskan umat, yaitu:
- Pendidikan Anak Usia Dini (PAUD)
- Raudhatul Atfal (RA)
- Madrasah Ibtidaiyah (MI)
- Madrasah Tsanawiyah (MTs)
- Madrasah Aliyah (MA)
- Madrasah Diniyah (MD)
- Pesantren Salafiyah
- Majlis Ta’lim